نالت مكتبات الجامعة جائزة التميز للفهرس العربي الموحد للعام 2013 وذلك خلال مشاركتها في اللقاء السادس للفهرس العربي الموحد الذي عقد في الدار البيضاء في الفترة 11-12 ايلول 2013 ، حيث قدم منصور دراغمة، من مكتبات الجامعة ورقة عمل أعدها مع الأستاذ هاني جبر، مدير المكتبات حول المشاركة الإيجابية لمكتبات الجامعة كنموذج للمشاركة في تطوير الفهرس العربي الموحد للتعريف بمكتبات جامعة النجاح الوطنية من حيث نشأتها وموقعها ومساحتها، إضافة إلى المعالجة الفنية للمجموعات القرائية، ووضعية الأوعية العربية في مكتبة الجامعة قبل عضويتها في الفهرس الموحد.
وقام بتوزيع الجائزة على الفائزين وزير الأوقاف المغربي الدكتور احمد التوفيق، ووزير التعليم العالي والبحث العلمي الدكتور حسن الداودي، ووزير الثقافة الدكتور محمد الأمين الصبحي، ونائب المشرف العام لمكتبة الملك عبد العزيز بالمغرب الدكتور عبد الكريم الزيد.